Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lrif1Q8CDD9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrif1Q8CDD9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lrif1Q8CDD9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrif1Q8CDD9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrif1Q8CDD9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrif1Q8CDD9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrif1Q8CDD9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Lrif1Q8CDD9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lrif1Q8CDD9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lrif1Q8CDD9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Lrif1Q8CDD9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Lrif1Q8CDD9 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lrif1Q8CDD9 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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