Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB12

Gsdmc3, Gasdermin-C3, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsdmc3Q8CB12 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Gsdmc3Q8CB12 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gsdmc3Q8CB12 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms