Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms