Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdac7Q8C2B3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms