Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX70

Vps13c, Vacuolar protein sorting-associated protein 13C, mousemouse

Predictions only

Length 3,748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps13cQ8BX70 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vps13cQ8BX70 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Vps13cQ8BX70 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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