Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ube3dQ8BX13 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Ube3dQ8BX13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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