Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cops7bQ8BV13 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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