Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Kdm5bQ80Y84 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Kdm5bQ80Y84 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Kdm5bQ80Y84 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms