Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Pcsk9Q80W65 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pcsk9Q80W65 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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