Protein–RNA interactions for Protein: Q80V85

Trim62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim62Q80V85 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trim62Q80V85 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim62Q80V85 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trim62Q80V85 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim62Q80V85 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim62Q80V85 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim62Q80V85 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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