Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Clec18aQ7TSQ1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Clec18aQ7TSQ1 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms