Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSL0

Ifnk, Interferon kappa, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnkQ7TSL0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
IfnkQ7TSL0 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms