Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TwistnbQ78WZ7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms