Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SynmQ70IV5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SynmQ70IV5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms