Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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RfflQ6ZQM0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RfflQ6ZQM0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RfflQ6ZQM0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RfflQ6ZQM0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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RfflQ6ZQM0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RfflQ6ZQM0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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RfflQ6ZQM0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RfflQ6ZQM0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RfflQ6ZQM0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
RfflQ6ZQM0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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