Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFF0

Scaf4, SR-related CTD-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf4Q6PFF0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Scaf4Q6PFF0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Scaf4Q6PFF0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms