Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Papd7Q6PB75 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Papd7Q6PB75 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms