Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
NipblQ6KCD5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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