Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mvb12bQ6KAU4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mvb12bQ6KAU4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms