Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
CltbQ6IRU5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
CltbQ6IRU5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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