Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atg9bQ6EBV9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms