Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z98

Brsk2, Serine/threonine-protein kinase BRSK2, mousemouse

Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brsk2Q69Z98 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Brsk2Q69Z98 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Brsk2Q69Z98 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms