Protein–RNA interactions for Protein: Q64444

Ca4, Carbonic anhydrase 4, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca4Q64444 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ca4Q64444 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ca4Q64444 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms