Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ift52Q62559 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ift52Q62559 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms