Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CochQ62507 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CochQ62507 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CochQ62507 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CochQ62507 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CochQ62507 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CochQ62507 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CochQ62507 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CochQ62507 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms