Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Vat1Q62465 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vat1Q62465 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vat1Q62465 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vat1Q62465 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vat1Q62465 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.3 ms