Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Six3Q62233 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Six3Q62233 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Six3Q62233 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Six3Q62233 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six3Q62233 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Six3Q62233 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Six3Q62233 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms