Protein–RNA interactions for Protein: Q62219

Tgfb1i1, Transforming growth factor beta-1-induced transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1i1Q62219 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tgfb1i1Q62219 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Tgfb1i1Q62219 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms