Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Rbm38Q62176 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Rbm38Q62176 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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