Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rai1Q61818 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rai1Q61818 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rai1Q61818 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Rai1Q61818 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rai1Q61818 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms