Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Sox17Q61473 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Sox17Q61473 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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