Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Klf4Q60793 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Klf4Q60793 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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