Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Xrcc1Q60596 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms