Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psme4Q5SSW2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms