Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
AbrQ5SSL4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms