Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Utp18Q5SSI6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Utp18Q5SSI6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms