Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim58Q5NCC9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms