Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Fam20cQ5MJS3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Fam20cQ5MJS3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms