Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Syce1lQ5D525 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Syce1lQ5D525 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms