Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc3lQ4KL14 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc3lQ4KL14 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms