Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2al1nQ497L1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
H2al1nQ497L1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms