Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Prr7Q3V0I2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Prr7Q3V0I2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms