Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Kdm5aQ3UXZ9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms