Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Defb48Q3UW22 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Defb48Q3UW22 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms