Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp30Q3UN04 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp30Q3UN04 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp30Q3UN04 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp30Q3UN04 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Usp30Q3UN04 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp30Q3UN04 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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