Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW8

Parp3, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp3Q3ULW8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Parp3Q3ULW8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Parp3Q3ULW8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms