Protein–RNA interactions for Protein: Q3UC65

Rsrp1, Arginine/serine-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsrp1Q3UC65 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rsrp1Q3UC65 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsrp1Q3UC65 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms