Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LcorlQ3U285 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorlQ3U285 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms