Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrrc28Q3TX51 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Lrrc28Q3TX51 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrrc28Q3TX51 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrrc28Q3TX51 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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