Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

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Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Shcbp1lQ3TTP0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
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